表面活性劑的生物降解是微生物將表面活性劑分解為二氧化碳和水的過程。這一過程可分為三個階段:改變材料性質的初級生物降解;以及二氧化碳和水等無機物質的Z終生物降解。世界經濟合作與發展組織(world organization for economic cooperation development)規定,允許使用一次生物降解率大于80%,Z終生物降解率大于70%的表面活性劑。難降解根據表面活性劑的化學結構,脂肪族比芳香族更易降解,直鏈比支鏈更易降解;極性基團中的羧基、磺酸、硫酸和乙氧基更易降解。因此,直鏈烷基化合物、烷基醇聚氧乙烯化合物、烷基糖苷和生物表面活性劑容易降解。降解機理表面活性劑的降解機理不同。對于直鏈烷基苯磺酸鹽,烷烴端的甲基鏈和烷基鏈被連續氧化,然后除去磺化基團并破壞苯環。Z后,它被降解成二氧化碳、水和硫酸鹽。烷基醇聚氧乙烯化合物通常受到酯酶、脫氧酶和乙醚酶的作用。期望隨著人們環保意識的增強,可生物降解表面活性劑的設計、生產和使用是今后的發展方向。